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Leçon 4/15 · La SISA, de la création à la vie de la société

Fiscalité de la SISA : IR, TVA, rémunérations

Le régime fiscal de principe d'une SISA, l'option pour l'impôt sur les sociétés, ce que vous déclarez personnellement — et la ligne au-delà de laquelle seul votre expert-comptable peut répondre.

18 min de lectureVérifié le 15/08/2026

L'essentiel en 3 points

  • Par défaut, la SISA ne paie pas d'impôt sur son résultat : celui-ci est réparti entre les associés, qui le déclarent chacun (art. 8, 7° du code général des impôts).
  • Une option pour l'impôt sur les sociétés existe depuis les exercices ouverts au 1er janvier 2017. C'est une décision lourde, à instruire avec votre expert-comptable.
  • Cette leçon vous donne le vocabulaire et les régimes de principe. Elle ne remplace pas l'analyse de votre situation, et n'a aucune vocation à vous suggérer un montage.

Ce que cette leçon ne fait pas — et pourquoi

Vous ne trouverez ici aucun conseil d'optimisation, aucune comparaison du type « il vaut mieux tel régime que tel autre », aucune recommandation applicable à votre structure.

Ce n'est pas de la prudence excessive. La bonne réponse dépend de la composition de votre équipe, de vos autres structures, du niveau des sommes en jeu, de la situation personnelle de chaque associé et de la date de clôture retenue. Le seul professionnel qui dispose de ces éléments est votre expert-comptable, et pour certaines questions, un avocat fiscaliste.

Ce que vous pouvez faire ici : comprendre la mécanique, pour poser des questions précises et comprendre les réponses. C'est déjà beaucoup — la plupart des malentendus sur ce sujet viennent d'un vocabulaire mal compris, pas d'un désaccord de fond.

Le régime de principe : la société ne paie pas, les associés déclarent

La SISA relève de droit du régime des sociétés de personnes : c'est le 7° de l'article 8 du code général des impôts qui le prévoit expressément. Concrètement, cela veut dire que la société établit bien un résultat, mais qu'elle n'est pas elle-même redevable de l'impôt sur ce résultat.

Le résultat est réparti entre les associés à proportion de leurs droits dans la société, et chacun reprend sa quote-part dans sa propre déclaration de revenus. « Droits » s'entend ici de la répartition effectivement arrêtée par le collectif avant la clôture (statuts, règlement intérieur ou décision d'assemblée) — qui peut différer du pourcentage de capital. C'est cette répartition-là que chacun reprend dans sa déclaration. La catégorie d'imposition suit la nature de l'activité de chacun : pour la plupart des professionnels de santé associés, il s'agit des bénéfices non commerciaux ; la doctrine fiscale prévoit un traitement en bénéfices industriels et commerciaux lorsque les parts sont inscrites à l'actif d'une entreprise commerciale — le cas type étant celui d'un pharmacien.

D'où la réponse à la question la plus fréquemment posée en assemblée : « l'argent que la SISA me reverse, je le déclare ? » — oui. Les modalités exactes, la ligne, le millésime et l'articulation avec vos autres revenus professionnels relèvent de votre expert-comptable.

Aller plus loinGuideDGFiP (BOFiP-Impôts)National

BIC - Champ d'application et territorialité - Sociétés interprofessionnelles de soins ambulatoires (SISA)

La doctrine fiscale de référence : elle détaille l'imposition entre les mains de chaque associé, au prorata de ses droits dans la société.

Lien vérifié le 18/08/2026

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  • La SISA

    Ce qu'il fait
    Tient sa comptabilité, établit un résultat annuel, le répartit entre les associés
    Ce qu'il ne fait pas
    Elle n'acquitte pas l'impôt sur ce résultat, sauf option pour l'impôt sur les sociétés
  • Chaque associé

    Ce qu'il fait
    Reprend sa quote-part de résultat dans sa propre déclaration de revenus
    Ce qu'il ne fait pas
    Il ne peut pas « laisser » sa quote-part dans la société pour échapper à l'imposition
  • L'expert-comptable

    Ce qu'il fait
    Détermine le résultat, la répartition, la catégorie et les modalités déclaratives
    Ce qu'il ne fait pas
    Il ne peut pas travailler sans une comptabilité tenue et des flux séparés par entité
  • Le gérant

    Ce qu'il fait
    Fournit les pièces, fait approuver les comptes en assemblée, conserve les procès-verbaux
    Ce qu'il ne fait pas
    Il n'arbitre ni le régime fiscal, ni les modalités déclaratives des associés
Qui paie quoi, dans le régime de principe

L'option pour l'impôt sur les sociétés

Depuis les exercices ouverts à compter du 1er janvier 2017, une SISA peut opter pour son assujettissement à l'impôt sur les sociétés, dans les conditions de l'article 239 du code général des impôts. La société devient alors elle-même redevable de l'impôt sur son résultat, et la logique de répartition chez les associés change entièrement.

Deux points de calendrier valent d'être connus, parce qu'ils sont contre-intuitifs :

  • l'option n'est plus irrévocable pour toujours. Depuis la loi de finances pour 2019, un droit de renonciation existe : il s'exerce jusqu'au cinquième exercice suivant celui au titre duquel l'option a été exercée ;
  • passé ce délai, en l'absence de renonciation, l'option devient définitive. Il n'y a pas de session de rattrapage.

Ne lisez pas ces lignes comme un encouragement, ni comme une mise en garde. C'est une porte qui existe, avec un calendrier précis. Savoir qu'elle existe et qu'elle se referme est exactement ce qui vous permet d'en parler à temps avec votre expert-comptable, plutôt que de découvrir la question au moment où elle n'est plus ouverte.

Aller plus loinGuideLégifranceNational

Article 239 - Code général des impôts

Le texte de l'option : la notification avant la fin du troisième mois de l'exercice, et le calendrier exact du droit de renonciation.

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Aller plus loinGuideDGFiP (BOFiP-Impôts)National

BIC - IS - RSA - ENR - Option des SISA pour leur assujettissement à l'impôt sur les sociétés

L'annonce de l'ouverture de cette option en 2017, et son caractère devenu définitif passé le délai de renonciation.

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TVA : ce qui est établi, et ce qui ne l'est pas

Ce qui est établi : les prestations de soins à la personne effectuées dans le cadre des professions médicales et paramédicales réglementées sont exonérées de TVA (article 261, 4-1° du code général des impôts). Cette exonération s'apprécie au niveau de chaque professionnel, dans son exercice.

Ce qui l'est beaucoup moins : le traitement, au regard de la TVA, de ce que la SISA elle-même encaisse ou refacture. Le sujet fait l'objet d'analyses divergentes selon la nature exacte du flux — rémunération d'activités exercées en commun, refacturation de moyens, mise à disposition de personnel entre entités — et nous ne l'affirmerons pas ici.

La conduite à tenir est simple : avant de facturer ou de refacturer quoi que ce soit entre vos structures, posez la question par écrit à votre expert-comptable, et gardez sa réponse. Une refacturation mise en place « comme le voisin » et jamais réexaminée est un risque bien réel ; une question posée avant coûte une heure.

Aller plus loinGuideLégifranceNational

Article 261 - Code général des impôts

Ce qui EST établi : le texte exact de l'exonération des soins dispensés par les membres des professions médicales et paramédicales réglementées.

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La conséquence que les équipes découvrent en embauchant : la taxe sur les salaires

Les deux sujets se tiennent, et c'est ce qui les rend faciles à manquer. L'article 231 du code général des impôts met la taxe sur les salaires à la charge des employeurs qui ne sont pas assujettis à la TVA, ou qui ne l'ont pas été sur au moins 90 % de leur chiffre d'affaires de l'année civile précédant le versement des rémunérations. À l'inverse, un employeur soumis à la TVA sur au moins 90 % de son activité en est hors champ ; entre les deux, la taxe ne porte que sur une fraction des rémunérations, proportionnelle à la part d'activité non soumise à la TVA.

Traduction pour une maison de santé : une structure dont les produits ne sont pas soumis à la TVA et qui emploie — une coordinatrice, une secrétaire — entre typiquement dans le champ de cette taxe. C'est un coût d'employeur qui ne figure sur aucun bulletin de paie et que les équipes découvrent souvent l'année suivante.

Ce que cette leçon ne peut pas faire : calculer votre situation. Le montant dépend de votre rapport d'assujettissement, du niveau de chaque rémunération, et de mécanismes d'abattement et de franchise qui évoluent. Posez la question à votre expert-comptable avant la première embauche, en même temps que celle de la convention collective — les deux se décident au même moment.

Aller plus loinGuideDGFiP (BOFiP-Impôts)National

Taxe sur les salaires - Champ d'application - Personnes imposables

Le seuil des 90 % expliqué avec ses deux bornes : en dessous, la taxe porte sur une fraction des rémunérations ; au-dessus, l'employeur y échappe entièrement.

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« Rémunération » ne veut pas dire « salaire »

Le mot rémunération est source de confusion permanente. Quand la SISA verse à un associé une somme au titre de son engagement dans les activités exercées en commun, ce n'est ni un salaire — il n'y a pas de contrat de travail, pas de lien de subordination — ni un honoraire de soins — le patient n'a rien payé pour cela.

Trois conséquences pratiques :

  • ces sommes entrent dans votre revenu professionnel et sont donc déclarées ; elles ne sont pas un « bonus » qui vivrait à part ;
  • elles ont une incidence sur vos cotisations sociales, dont le calcul dépend de votre situation : c'est une question pour votre expert-comptable et pour votre organisme de recouvrement, pas pour une assemblée générale ;
  • la traçabilité compte autant que le montant. Une somme versée sans décision votée, sans base écrite et sans pièce justificative est un problème comptable avant d'être un problème fiscal.

Le réflexe qui vous protège : une décision, un procès-verbal, un virement. Dans cet ordre.

Les Trois Rivières : la mécanique, en chiffres d'illustration

Exemple fictif — « Les Trois Rivières » est une équipe imaginaire qui sert de fil rouge chiffré à ces leçons ; aucun chiffre ci-dessous ne décrit une structure réelle. Les montants ci-dessous ne servent qu'à montrer l'enchaînement. Ils ne préjugent d'aucune situation réelle et ne constituent pas un modèle à recopier.

Sur un exercice, la SISA « Les Trois Rivières » a encaissé 82 000 € de rémunération d'équipe, et supporté 19 000 € de charges propres (salaire chargé de la coordinatrice, assurance, logiciel, frais bancaires, expert-comptable). Le résultat de l'exercice s'établit donc à 63 000 €.

Ce que la société paie sur ces 63 000 € au titre de l'impôt sur les bénéfices, dans le régime de principe : rien. Le résultat est réparti entre les neuf associés selon les droits retenus, et chacun reprend sa quote-part dans sa propre déclaration.

Ce que cela veut dire pour la trésorerie de l'équipe, et c'est le point que les associés découvrent le plus souvent en cours de route : la quote-part est imposable même si l'argent est resté sur le compte de la société. Décider de mettre en réserve ne décale pas l'imposition. C'est exactement le genre de sujet à mettre à l'ordre du jour de l'assemblée qui approuve les comptes, avec votre expert-comptable dans la boucle.

Guide SisaFlow — pas à pas dans l'application

Lire vos comptes par entité juridique

Séparer SISA, SCM et SCI dans la comptabilité est la condition pour que ces questions soient instruisables.

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Selon votre rôle

  • Gérant de SISA

    Votre rôle n'est pas de trancher ces questions, mais de savoir les poser et de fournir des comptes propres. Une réunion annuelle avec votre expert-comptable, préparée avec les bons documents, vaut mieux que six échanges de courriels dans l'urgence de mai.

  • Comptable / référent comptabilité

    Retenez la mécanique : la société établit un résultat, ce résultat est réparti, chaque associé le reprend dans sa propre déclaration. Votre travail consiste à ce que cette répartition soit traçable, associé par associé.

  • Expert-comptable partenaire

    Régime de droit de l'article 8, 7° du CGI, quote-part imposée en BNC pour la plupart des associés et en BIC lorsque les parts figurent à l'actif d'une entreprise commerciale. L'option IS de l'article 239 est ouverte depuis les exercices ouverts au 1er janvier 2017 ; le droit de renonciation issu de la loi de finances pour 2019 court jusqu'au cinquième exercice suivant celui de l'option.

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